Git for dummies (i.e., me)

Git for dummies (i.e., me)

Yes, I am trying to introduce GIT in my life (conflicted emoticon). I am getting quite tired of saving millions of versions of the same document having to scroll endlessly until finding the one I was looking for. In order to avoid this I am taking the following decisions:  Start using a control versions software. Start to write in markdown documents and documenting every step I make. Especially when cleaning…

Three in a row

Three in a row

The ‘peer review’ system is broken, or so the say. In fact they have been saying this for quite some time now. There are more and more problems with irreproducibility and the number of retractions is growing every year (especially in elite journals). New alternatives are being suggested such as open peer review. Most of the critiques have to do with the publication of flawed results. Although the discussion is…

Creando un entorno para Python en Windows

Creando un entorno para Python en Windows

Este post es un apunte para mi yo futuro sobre cómo establecer python como variable de entorno e instalar pip para la gestión de paquetes. Toda la info está basada en esta entrada de Aaronontheweb. Aunque data de 2012, utiliza versiones tanto de Python como Windows aún vigentes. Estos son los pasos: Paso 1. Descargar e instalar Python (hasta aquí todo facilito). En mi caso, trabajo con Python 2.7 ya que al parecer…

Recursos para escribir artículos científicos

Recursos para escribir artículos científicos

Estas semanas estoy colaborando con EC3metrics impartiendo junto a Dani y Rafa el curso online ‘Estrategias para publicar en revistas de impacto en Ciencias Sociales‘. Esta semana toca módulo sobre escritura científica, así que he compartido con los alumnos una mini-recopilación de guías y sitios donde se habla sobre escritura científica y a los que suelo acudir con frecuencia. Aquí los incluyo: Guías del grupo de JLeek Jeff Leek y su…

Evolución del programa CIBER 2006-2011

Evolución del programa CIBER 2006-2011

El programa CIBER (Centros de Investigación Biomédica En Red) es una de las iniciativas en política científica más importantes que se han llevado a cabo en  España en las últimas décadas. Con un gasto anual medio de alrededor de 42 millones de euros, nació en 2006 persiguiendo los siguientes objetivos: Promocionar la investigación biomédica de excelencia mediante el establecimiento de estructuras en red estables Promover la colaboración entre diversos grupos de…

Montando servidor para uso interno

Montando servidor para uso interno

He decidido empezar a organizarme en condiciones y montar mi pequeña gran base de datos interna. En mis intentos por utilizar R, me doy cuenta de lo difícil que resulta procesar datos en este lenguaje en comparación con lo fácil que resulta emplearlo para hacer análisis una vez los datos están bien tabulados y bonitos. Tras las consultas pertinentes, me voy a declinar por Mariadb, una distribución de MySQL Open…

Publishing, review delays and preprints

Publishing, review delays and preprints

These are just some quotes I found of interest from a recent news piece in Nature: ‘Does it take too long to publish?‘ researchers are increasingly questioning the time it takes to publish their work. Many say that they feel trapped in a cycle of submission, rejection, review, re-review and re-re-review that seems to eat up months of their lives, interfere with job, grant and tenure applications and slow down…

Universities and their cities

Universities and their cities

UPDATE 09/02/2016: Just came up with this interesting project (which has ended with a book which is expected to be published this year) on the Civic University by John Goddard and Paul Vallance. Here the notes from a lecture of John Goddard. There seems to be a positive non-linear relation between universities and cities on their attraction to talent. Either by indirect influences or by third stream activities, one could presume…

Gestión y monitorización del CV científico

Gestión y monitorización del CV científico

ACTUALIZACIÓN: Ya está accesible el material del curso. Gestión y Monitorización de la información y el impacto científico: Perfiles, alertas e identificadores from Torres Salinas Entre el jueves 21 y el lunes 25 de enero estuve con Daniel, Esteban y Evaristo, impartiendo el curso ‘Gestión y monitorización de la información y el impacto científico‘ organizado por el Vicerrectorado para la Garantía de la Calidad de la Universidad de Granada. En un…

Reviewing peer review

Reviewing peer review

Recently I have encountered the service Rubriq which intends to revolutionize the peer review system by providing an independent panel of reviewers. It pays a $100 to reviewers if they submit their review within 4 or 5 days since the reception of the manuscript. Launched in 2012 and with its own promotional paper at Nature, Rubriq belongs to the firm Research Square, it is based on the idea of centralizing peer…